2004 yılında İstanbul Ticaret Üniversitesi’ndeki görevine başladı. Aynı yıl Ticaret Üniversitesi Uluslararası Ticaret bölümünde yüksek lisans programına kayıt oldu ve 2006 yılında bu bölümü tamamladı. 2005 yılında Ticaret Üniversitesi Hazırlık Okulu bünyesinde öğretmenlerin materyal paylaşabilecekleri bir platform oluşturdu. Bu platform çok kısa süre binlerce otantik materyalin yer aldığı bir veritabanı haline geldi.
İstanbul Ticaret Üniversitesinin tüm fakülte ve bölümlerinde mesleki İngilizce ve iş İngilizcesi dersleri verdi. Aynı zamanda Bankacılık ve Finans, Uluslararası Ticaret, Medya ve İletişim Sistemleri, Görsel İletişim ve Tasarım bölümleri için materyaller hazırladı ve kitaplar derledi.
Aynı yıllarda ETS (Educational Testing Service) tarafından hazırlanan TOEFL IBT eğitimlerine katıldı ve akademik İngilizce sınavları ile ilgili çalışmalar yürütmeye başladı. Bu dönemde yüzlerce öğrenciyi TOEFL IBT ve IELTS sınavlarına hazırladı. Aynı zamanda YDS üzerine çeşitli materyaller derledi ve yine yüzlerce öğrenciyi bu sınava hazırladı.
Son yıllarda özellikle uzaktan eğitim ve otantik materyallerin eğitim amaçlı kullanımı ile ilgili çalışmalarda bulunan Seçkin Girgin Ticaret Üniversitesi’ndeki görevinin yanısıra TemaDil bünyesinde uzaktan eğitim programlarının oluşturulmasında görev almaktadır.